MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium kroppenstedtii DSM 44385 chromosome

Total Repeats: 46324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012704	GCGA	2	8	37	44	25 %	0 %	50 %	25 %	237784638
2	NC_012704	AAGC	2	8	163	170	50 %	0 %	25 %	25 %	237784638
3	NC_012704	CGG	2	6	189	194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784638
4	NC_012704	ATC	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784638
5	NC_012704	CCG	2	6	266	271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237784638
6	NC_012704	CTG	2	6	323	328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784638
7	NC_012704	GACG	2	8	336	343	25 %	0 %	50 %	25 %	237784638
8	NC_012704	TTC	2	6	345	350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237784638
9	NC_012704	GCC	2	6	372	377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237784638
10	NC_012704	CTC	2	6	389	394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237784638
11	NC_012704	TTC	2	6	578	583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237784638
12	NC_012704	TCCA	2	8	615	622	25 %	25 %	0 %	50 %	237784638
13	NC_012704	CACC	2	8	638	645	25 %	0 %	0 %	75 %	237784638
14	NC_012704	AC	3	6	695	700	50 %	0 %	0 %	50 %	237784638
15	NC_012704	CAA	2	6	741	746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784638
16	NC_012704	TCG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784638
17	NC_012704	AGT	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237784638
18	NC_012704	TTC	2	6	947	952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237784638
19	NC_012704	TCGA	2	8	1009	1016	25 %	25 %	25 %	25 %	237784638
20	NC_012704	CAA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784638
21	NC_012704	CTG	2	6	1099	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784638
22	NC_012704	CTGG	2	8	1123	1130	0 %	25 %	50 %	25 %	237784638
23	NC_012704	TTC	2	6	1153	1158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237784638
24	NC_012704	GTGCT	2	10	1198	1207	0 %	40 %	40 %	20 %	237784638
25	NC_012704	AGCGG	2	10	1332	1341	20 %	0 %	60 %	20 %	237784638
26	NC_012704	GC	3	6	1418	1423	0 %	0 %	50 %	50 %	237784638
27	NC_012704	CA	3	6	1456	1461	50 %	0 %	0 %	50 %	237784638
28	NC_012704	GGT	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237784638
29	NC_012704	CGA	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784638
30	NC_012704	GAC	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784638
31	NC_012704	CTGAC	2	10	1580	1589	20 %	20 %	20 %	40 %	237784638
32	NC_012704	CG	3	6	1620	1625	0 %	0 %	50 %	50 %	237784638
33	NC_012704	CAA	2	6	1683	1688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784638
34	NC_012704	CGG	2	6	1692	1697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784638
35	NC_012704	ACCAC	2	10	1703	1712	40 %	0 %	0 %	60 %	237784638
36	NC_012704	GAAA	2	8	1740	1747	75 %	0 %	25 %	0 %	237784638
37	NC_012704	CGA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784638
38	NC_012704	CG	3	6	1791	1796	0 %	0 %	50 %	50 %	237784638
39	NC_012704	TTC	2	6	2577	2582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237784639
40	NC_012704	ATG	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237784639
41	NC_012704	CCG	2	6	2598	2603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237784639
42	NC_012704	ACG	2	6	2604	2609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784639
43	NC_012704	TCG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784639
44	NC_012704	ATT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237784639
45	NC_012704	CA	3	6	2736	2741	50 %	0 %	0 %	50 %	237784639
46	NC_012704	GGA	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237784639
47	NC_012704	CTG	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784639
48	NC_012704	CGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784639
49	NC_012704	CGC	2	6	2989	2994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237784639
50	NC_012704	CGT	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784639
51	NC_012704	ACA	3	9	3206	3214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784639
52	NC_012704	GTT	2	6	3250	3255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237784639
53	NC_012704	ATT	2	6	3298	3303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237784639
54	NC_012704	GGA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237784639
55	NC_012704	GGA	2	6	3415	3420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237784639
56	NC_012704	TCGA	2	8	3497	3504	25 %	25 %	25 %	25 %	237784639
57	NC_012704	CCCG	2	8	3540	3547	0 %	0 %	25 %	75 %	237784639
58	NC_012704	ACCT	2	8	3626	3633	25 %	25 %	0 %	50 %	237784639
59	NC_012704	GTG	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237784640
60	NC_012704	ACG	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784640
61	NC_012704	GC	3	6	3976	3981	0 %	0 %	50 %	50 %	237784640
62	NC_012704	GCT	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784640
63	NC_012704	T	6	6	4058	4063	0 %	100 %	0 %	0 %	237784640
64	NC_012704	GGCA	2	8	4152	4159	25 %	0 %	50 %	25 %	237784640
65	NC_012704	GCT	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784640
66	NC_012704	GGA	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237784640
67	NC_012704	TGACTC	2	12	4251	4262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	237784640
68	NC_012704	CGGC	2	8	4304	4311	0 %	0 %	50 %	50 %	237784640
69	NC_012704	CGTA	2	8	4358	4365	25 %	25 %	25 %	25 %	237784640
70	NC_012704	A	6	6	4365	4370	100 %	0 %	0 %	0 %	237784640
71	NC_012704	ATG	2	6	4478	4483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237784640
72	NC_012704	GTT	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237784640
73	NC_012704	CGG	2	6	4537	4542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784640
74	NC_012704	CGA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784640
75	NC_012704	TTG	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237784640
76	NC_012704	CAGC	2	8	4615	4622	25 %	0 %	25 %	50 %	237784640
77	NC_012704	GCCA	2	8	4633	4640	25 %	0 %	25 %	50 %	237784640
78	NC_012704	CGA	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784640
79	NC_012704	GCC	2	6	4753	4758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237784640
80	NC_012704	CG	3	6	4765	4770	0 %	0 %	50 %	50 %	237784640
81	NC_012704	GAC	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784640
82	NC_012704	TGG	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237784640
83	NC_012704	AGG	2	6	4980	4985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237784640
84	NC_012704	ATGA	2	8	4994	5001	50 %	25 %	25 %	0 %	237784640
85	NC_012704	TGC	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784641
86	NC_012704	ACA	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784641
87	NC_012704	ACC	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237784641
88	NC_012704	GAAG	2	8	5204	5211	50 %	0 %	50 %	0 %	237784641
89	NC_012704	A	6	6	5219	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	237784641
90	NC_012704	TCG	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784641
91	NC_012704	ACT	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784641
92	NC_012704	GAT	2	6	5506	5511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237784641
93	NC_012704	GACAC	2	10	5516	5525	40 %	0 %	20 %	40 %	237784641
94	NC_012704	CAC	2	6	5603	5608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237784641
95	NC_012704	CGT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784641
96	NC_012704	GGC	2	6	5664	5669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784641
97	NC_012704	TGC	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784642
98	NC_012704	ACG	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
99	NC_012704	ACC	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237784642
100	NC_012704	GTC	2	6	6046	6051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784642
101	NC_012704	CGA	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
102	NC_012704	CACC	2	8	6179	6186	25 %	0 %	0 %	75 %	237784642
103	NC_012704	CGG	2	6	6216	6221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784642
104	NC_012704	GGT	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237784642
105	NC_012704	CGT	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784642
106	NC_012704	A	6	6	6385	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	237784642
107	NC_012704	GAC	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
108	NC_012704	CCTT	2	8	6494	6501	0 %	50 %	0 %	50 %	237784642
109	NC_012704	CGA	2	6	6567	6572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
110	NC_012704	AGC	2	6	6585	6590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
111	NC_012704	GCG	2	6	6592	6597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784642
112	NC_012704	TGCCGA	2	12	6618	6629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	237784642
113	NC_012704	AAG	2	6	6640	6645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237784642
114	NC_012704	CGGA	2	8	6655	6662	25 %	0 %	50 %	25 %	237784642
115	NC_012704	CAA	2	6	6708	6713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784642
116	NC_012704	CGA	2	6	6734	6739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
117	NC_012704	TCA	2	6	6740	6745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784642
118	NC_012704	CGA	2	6	6762	6767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
119	NC_012704	CGAGGT	2	12	6771	6782	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	237784642
120	NC_012704	CCGCG	2	10	6876	6885	0 %	0 %	40 %	60 %	237784642
121	NC_012704	CGT	2	6	6890	6895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784642
122	NC_012704	CG	4	8	6909	6916	0 %	0 %	50 %	50 %	237784642
123	NC_012704	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
124	NC_012704	AGACGA	2	12	7025	7036	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	237784642
125	NC_012704	CGAAG	2	10	7119	7128	40 %	0 %	40 %	20 %	237784642
126	NC_012704	ATT	2	6	7129	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237784642
127	NC_012704	CAA	2	6	7137	7142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784642
128	NC_012704	TCG	3	9	7150	7158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784642
129	NC_012704	GC	3	6	7162	7167	0 %	0 %	50 %	50 %	237784642
130	NC_012704	GGC	2	6	7170	7175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784642
131	NC_012704	TCG	2	6	7197	7202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784642
132	NC_012704	GGC	2	6	7222	7227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784642
133	NC_012704	TGG	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237784642
134	NC_012704	TTC	2	6	7349	7354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237784642
135	NC_012704	GAA	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237784642
136	NC_012704	ATC	2	6	7429	7434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784642
137	NC_012704	ATC	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784642
138	NC_012704	CTG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784642
139	NC_012704	TGG	2	6	7580	7585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237784642
140	NC_012704	TGA	2	6	7677	7682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237784642
141	NC_012704	TTG	2	6	7684	7689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237784642
142	NC_012704	CAA	2	6	7719	7724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237784642
143	NC_012704	GAT	2	6	7726	7731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237784642
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145	NC_012704	TTC	2	6	7811	7816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237784642
146	NC_012704	GGA	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237784642
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148	NC_012704	GAC	2	6	7876	7881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784642
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150	NC_012704	TATG	2	8	8335	8342	25 %	50 %	25 %	0 %	237784643
151	NC_012704	CAT	3	9	8365	8373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784643
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153	NC_012704	GCG	2	6	8521	8526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784643
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156	NC_012704	ATGGGT	2	12	8738	8749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	237784643
157	NC_012704	TCG	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784643
158	NC_012704	CAT	2	6	8828	8833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784643
159	NC_012704	ATC	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784643
160	NC_012704	GTC	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784643
161	NC_012704	CGG	2	6	9002	9007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784643
162	NC_012704	ATC	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237784643
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164	NC_012704	GCA	2	6	9243	9248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237784643
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261	NC_012704	GGC	2	6	15542	15547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237784649
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381	NC_012704	AGA	2	6	22277	22282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237784654
382	NC_012704	A	6	6	23267	23272	100 %	0 %	0 %	0 %	237784655
383	NC_012704	TGA	2	6	23275	23280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237784655
384	NC_012704	TTG	2	6	23300	23305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237784655
385	NC_012704	TCG	2	6	23310	23315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237784655
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387	NC_012704	TTTC	2	8	23447	23454	0 %	75 %	0 %	25 %	237784656
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